科學家揭示了一種我們的DNA可以從頭開始制造新基因的新方法
科學家們已經發現,我們的DNA如何使用基因快進按鈕來制造新的基因,以快速適應我們不斷變化的環境。
在對DNA復制錯誤的調查中,芬蘭赫爾辛基大學的研究人員發現,某些單一突變會產生回文,這些回文的前后讀數相同。在適當的情況下,這些可以演變成微核糖核酸(miRNA)基因。
這些微小而簡單的基因在調節其他基因中起著重要作用。許多miRNA基因在進化史上已經存在了很長時間,但科學家發現,在一些動物群體中,如靈長類動物,全新的miRNA基因突然出現.
“從無到有的新基因的出現讓研究人員著迷,”說生物信息學家Heli M?nttinen,這項新研究的第一作者。
“我們現在有一個優雅的RNA基因進化模型。
允許這種非常有效的基因創建方法的錯誤稱為模板切換突變(TSM)。與TSM相關的miRNA產生過程比新的功能蛋白的進化速度要快得多。
“DNA一次復制一個堿基,通常突變是錯誤的單一堿基,就像筆記本電腦鍵盤上的打錯一樣。說項目負責人兼生物信息學家Ari L?ytynoja。
“我們研究了一種產生更大錯誤的機制,比如從另一個上下文復制粘貼文本。我們對向后復制文本以創建回文的情況特別感興趣。
所有RNA分子都需要重復的堿基集,將分子鎖定在其工作形狀中。該團隊選擇專注于microRNA基因,這些基因非常短,由大約22個基因組成堿基對.
但即使對于簡單的microRNA基因,隨機堿基突變緩慢形成這種回文運行的幾率也非常低。
科學家們一直對這些回文序列的來源感到困惑。事實證明,TSM可以快速產生完整的DNA回文,從以前非編碼的DNA序列中產生新的microRNA基因。
“在RNA分子中,相鄰回文的堿基可以配對并形成類似于發夾的結構。這種結構對RNA分子的功能至關重要。說生物技術專家Mikko Frilander。
許多靈長類動物和哺乳動物的完整基因組已經繪制出來。通過使用自定義計算機算法比較這些基因組,研究人員能夠找出哪些物種具有microRNA回文對。
“通過對歷史的詳細建模,我們可以看到整個回文是由單個突變事件創建的,”M?nttinen解釋.
下圖很好地說明了該過程。當DNA復制開始通過其配方列表中的每個堿基對時,當它遇到突變或有缺陷的堿基對時,它就會停止。
然后,復制跳轉到相鄰模板,并開始向后復制這些指令。
當復制返回到原始模板時,這將創建一個微小的回文,該回文可以在發夾結構中與自身配對。
DNA復制過程中的模板切換允許單個突變事件在DNA中為新的miRNA基因創建完美的結構。這比可能發生的緩慢而漸進的變化要有效得多單個構建塊.
在靈長類動物的家譜中,發現了超過6000個這樣的結構,這些結構可能在人類中產生了至少18個全新的miRNA基因。這是自靈長類動物首次出現以來被認為出現的所有miRNA的26%。
像這樣的發現跨越了進化線,指出了一種通用的miRNA基因創造機制,研究小組認為這些結果也可以應用于其他RNA基因和分子。
新的microRNA基因似乎相對容易出現,可能會影響人類健康。一些與TSM相關的miRNA已經顯示出功能意義,如哈斯-米爾-576這會影響靈長類動物的抗病毒反應。
“許多能夠成為miRNA基因的TSM變體在人群中分離,”作者寫,“表明TSM過程是活躍的,現在正在塑造我們的基因組。
該研究已發表在美國國家科學院院刊.